张居正就去了侍御司，让承旨大臣拟了诏责枢密院调兵平吴地叛乱的诏书，而也给海瑞去了旨，让其先总督东南军务平叛。
而已经到内阁的海瑞和孙光祐等联名上的关于撤亲军卫回京师的奏疏也被驳回，且遭到了内阁申饬。
张居正甚至还对朱赓吩咐道：“如今吴地盗贼横行，与抚按在地方缉捕不力未曾没有关系，对于孙光祐、田乐、吕藿、李颐、李已等南直官直接罚没半年俸禄和年终奖掖银！令其戴罪立功，若再地方不靖，皆不臣之罪，逮拿进京！”
“对于这些旨意，都得以军情十万火急为由，直接要求枢密院八百里急递送达。”
八百里急递速度很快，在没几日后，诏旨与御批就都到了海瑞手里。
“被骂了！”
海瑞看见御批内容后，笑着说了起来，然后又笑着说：“骂的好，骂的好呀！”
说后，海瑞就把御批递给了胡守仁，然后就沉着脸对胡守仁、吕坤、汤传勋三人说：
“既然朝廷决心已下，将这些豪右怂恿之恶霸流氓定性为反贼，我们也没什么可说的了，照旨进行就是！”
“募集训练起来的各巡警队按照本堂早已定好的安排，一部分去巡视抓，抓到即杀，恢复秩序；尤其是，要把那几个哭庙和设立议事局的抓起来处决掉！”
“也没必要审，审肯定审不出来什么，背后的人没那么傻，把自己的狐狸尾巴，要抓幕后之人还得靠我们自己的眼线！”
“另一部分，也鼓动百姓去官衙闹，要求官绅们减租减息和提高薪酬；”
“本堂以总督东南之权，准他们设立农社、工社，以要求乡议更符合民愿；”
“如果官绅豪右要搞武力镇压，附近之巡警队有权直接弹压！”
“但国税司的金吾卫官兵不必全部派出去，轮班留一千总部，以备发生大规模动乱时，有足够充足的兵力予以镇压！”
“首先要镇压的就是拦阻锦衣卫差员进镇江城的三千悍民！”
三人拱手称是，皆精神十足的照办起来。
海瑞答应巡抚孙光祐等文官，会上疏请示朝廷是否撤回亲军卫，而消弭动乱后，他就没闲着。
海瑞一边让金吾卫的官兵迅速募集训练之前就熟识的青壮百姓，组建巡警队；一边让金吾卫的得力骨干去卧底摸排情况，还和锦衣卫接触，争取等巡警队训练完成后能迅速扑灭反贼；甚至还募集一批寒门士子，鼓励他们加入总督衙门充任帮办，帮着搞民众运动。
而在海瑞答应孙光祐等文官的同时，亲军卫也没再征税，只便衣散落在各乡村训练青壮百姓，所以民乱也减弱了不少，没有外面谣传的那么厉害。
但也的确还是有许多恶霸与地痞流氓，一旦仗了当地的豪右的势，就很难停下来。
再加上有些豪右竟也因此起了轻视公权之心，