崇焕要求修筑到二百里之外的宁远，但王在晋不听
袁崇焕两次直接将意见报告给首辅叶向高，但叶向高不知前线的情况，拿不定主意
这时大学士管兵部事孙承宗自请行边，亲赴山海关
孙承宗回京后，面奏王在晋不足任，“笔舌更自迅利，然沉雄博大之未能”，改任南京兵部尚书
不久王在晋就辞职了